AI 预测 CRISPR 工具活动
来自纽约大学、哥伦比亚大学和纽约基因组中心的研究人员开发了一个人工智能平台，可以预测针对 RNA 而不是 DNA 的 CRISPR 工具的脱靶活动。
该团队使用 CRISPR 筛选和深度学习模型来控制人类基因表达。 这类似于轻按开关将它们完全关闭或使用调光旋钮来减少它们的活动。 由此产生的神经网络称为 TIGER（通过 gRNA 设计靶向抑制基因表达），能够根据指导序列和上下文预测有效性。 该团队相信，新技术将为基于 CRISPR 的治疗中精确的基因控制铺平道路。
安德鲁·斯特恩 (Andrew Stirn) 是纽约基因组中心哥伦比亚工程学院的博士生。 他说深度学习模型可以告诉他如何创建一种引导RNA，从而完全敲除一个基因。 它也可以被“调整”，例如，让它只产生 70% 的转录本。 斯特恩是哥伦比亚大学工程学院和纽约基因组中心的博士生，也是研究人员在《自然生物技术》上发表的论文的共同第一作者。 这篇论文的标题是“利用深度学习预测 CRISPR Cas13D Guide RNA 的靶点（和脱靶）活性”，由 Stirn 撰写。
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