Syros Pharmaceuticals 基因组调控区研究

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任何特定细胞中表达的基因——开启、关闭、上升或下降——决定了它的类型和功能。当错误的基因在错误的时间或错误的数量表达时,就会导致疾病。

在 Syros,我们正在重新定义小分子控制基因表达的能力,通过这样做,我们的目标是对病人及其家属的生活产生深远的影响。加入我们来理解 Syros 团队在完成我们的任务时的协调表达。

基因组的调控区域控制着基因的表达,开启、关闭、上升或下降,就像调光开关一样,决定着细胞的行为。因为基因表达是所有细胞功能的基础,这些调控区域的改变实际上导致了所有疾病。然而,直到最近,科学家们还缺乏研究这些调控区域的工具,使得这些调控区域在很大程度上未被用于药物的发现和开发。

我们的平台是一个领先的平台,专注于监管基因组,以开发控制基因表达的小分子药物,目的是解决某些癌症和单基因疾病,而其他基于基因组的方法无法解决这些问题。

Dyno Therapeutics AAVs-腺相关病毒载体基因治疗先驱

“利用人工智能设计 AAV-腺相关病毒 运载工具舰队,为基因治疗创造联邦快递。”

Dyno:“重塑基因治疗格局,使用 AI 驱动的 AAV-腺相关病毒载体”

基因疗法有可能改变病人细胞内的基因,可能是我们最有力的医学工具之一ーー它有望成为“一劳永逸”的遗传疾病治疗方法。当涉及到这些疾病时,我们通常精确地知道我们想要传递的基因有效载荷,但并不总是有正确的载体将它们传递到体内相关的细胞。腺相关病毒(AAV)被认为是基本上对人类无害的,是我们今天用来在体内传递治疗基因的主要载体(载体)。但是 AAV 也有它的局限性: 它可能无法将足够的基因载荷传递给正确的细胞,它很难制造,它在高剂量下会有严重的安全问题,而且许多病人不适合使用基于 AAV 的疗法,因为他们对某些 AAV 已经存在免疫力。我们目前只有两种被批准的基因疗法,但业界希望到2025年底每年有多达10-20种细胞和基因疗法获得批准。基因疗法有可能治疗——甚至治愈——数以千计的恶性疾病。

AAV-腺相关病毒 载体的治疗潜力最初是在20多年前观察到的。从那时起,科学家们一直在寻求多种方法来发现、进化或设计具有增强特性和性能的新型 aav。我们能否找到一种专门针对中枢神经系统的 AAV 来治疗神经退行性疾病?或者设计一个更容易制造的 AAV?这是一座难爬的山。AAV 衣壳是一种精致、复杂的20边形结构。当为了改进它们而操纵它们的时候,一个错误的步骤就会导致一个急剧的“跌落”,打破衣壳。即使你可以在优化一个特性上取得进展(比如组织特异性靶向) ,它也常常以其他特性(比如制造性和免疫原性)的重大损失为代价。这就是为什么传统方法——定向进化或理性设计,甚至是希望发现其他自然产生的 aav ——很少能产生改良衣壳的原因。我们需要一种更有效的方法来摆脱自然 aav 的局限性,并充分实现基因治疗的前景。

曾在加州理工学院(Caltech)学习物理学、曾在乔治•丘奇(George Church)著名的哈佛实验室(Harvard lab)接受培训的埃里克•凯尔西克(Eric Kelsic)一直在思考人工智能(AI)在生物学领域可以解决的最棘手、最有价值的问题,并意识到人工智能是一种理想的工具,可以加速寻找更好的自动驾驶汽车。2018年,他与机器学习专家(也是教会实验室的校友)山姆 · 西奈、阿德里安 · 维尔斯、托马斯 · 比约克隆德、资深生物技术企业家艾伦 · 克莱恩和乔治 · 丘奇共同创立了 Dyno Therapeutics。Dyno 的任务是创建人工智能设计的具有转化传递特性的 AAV 载体,以覆盖人类疾病的广阔景观。该公司的 CapsidMap 平台全面调查 AAV 地形图,并找到最佳路线来优化多个参数并行,以便快速生成更高效、高特异性和免疫原性较低的 AAV。与传统方法相比,Dyno 的人工智能驱动方法已被证明是非常多产的: 他们设计了自然发生的 AAV 衣壳的增强肝靶向变体,并利用机器学习模型在计算机上筛选了数十亿潜在序列,以设计数千个可行的人工合成 AAV 衣壳ー验证使用先进的机器学习模型设计高度多样化的功能性 AAV 衣壳。除了创造变革性的治疗方法,生产性生物平台也可以使新的商业模式。如果人工智能是设计具有多种功能的新型 aav 阵列的理想工具,那么人工智能设计的 aav 可以加速和重塑整个基因治疗行业。从一开始,Dyno 就选择了放弃传统的投资自己产品流水线的方式(即开发自己的基因疗法) ,而是决定建立一个平台,作为水平的“基础设施”层,为所有基因疗法提供新型的 aav。Dyno 的方法在这里已经被证明是非常多产的: 该公司已经签署了合作伙伴关系,总价值可能超过40亿美元,为下一代的基因治疗领导者开发 AAV 载体,如肌肉疾病的 sarpta,眼疾的 Novartis,以及中枢神经系统和肝脏的罗奇/Spark Therapeutics。而这仅仅是他们攀登的开始。

Scribe Therapeutics

Scribe 正在构建一套 CRISPR 技术并将其应用于一个不断发展和扩展的单一的基因工程平台。

Scribe Therapeutics 为 CRISPR 公司提供了一个独一无二的解决方案,以解决这些限制: 它是从基础开始构建的,采用了一种技术方法。创始人出发的目的是设计出最好的 CRISPR 平台,从 CRISPR 的发现到 CRISPR 的设计有了大胆的飞跃。斯克里布超越了自然界中的一切,完全设计新颖的分子,扩展和完善进化所提供的一切。治疗用途的关键特性,如编辑功效、特异性、递送、靶向范围和免疫系统反应,现在都是直接设计的,通过一代又一代的迭代改进,形成了一个单一、完整的分子平台,克服了这些关键限制。这种方法已经产生了立竿见影的效果,团队达到了重要的里程碑,并在基本属性方面展示了巨大的改进,这些改进只会继续复合和增长。

PierianDX 基因组测序和基因组数据库

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受到人类基因组测序的鼓舞,基础科学的突破现在正在提供一鸣惊人的癌症疗法和其他关键迹象。圣路易斯的华盛顿大学是人类基因组计划的主要参与者,也是第一批利用下一代临床测序技术验证和报告其经验的学者之一。作为华盛顿大学的领导者,PierianDx 的创始人和校长拉凯什 · 纳加拉詹博士是技术支持解决方案的重要创新者,已定位 PierianDx 作为精准医学先驱。

H1 Platform

加入H1,进入美国所有医学专业人员最全面的数据集。该公司的网络拥有超过1000万个医疗服务提供商的资料,是生命科学公司、医院团体、医疗系统和医学界寻求与医生联系的首选搜索平台。个人档案是利用机器学习来摄取学术数据和医疗索赔数据,从而提供与专业知识无偏见的相关性。医生也可以为他们的档案做贡献。有了这样一个健壮的数据集,h1可以用于各种用例。例如,制药公司能够通过了解医生的患者人口统计特征来招募临床试验的参与者。

Encoded Therapeutics 基因疗法先驱

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转基因和基因编辑药物,利用病毒载体改变人体基因的疗法

基因疗法Etx101

Etx101提供一个转基因编码的工程 SCN1A 特异性转录因子(eTFSCN1A)上调,或增加内源性 SCN1A 基因的表达。转基因表达受 gaba 能抑制性神经元选择性调节元件(regaraba)控制。这种方法在内源性水平上增加了 NaV1.1的产生,从而恢复了抑制功能并最小化了潜在的非靶向效应。

Etx101利用了一种经过临床验证的腺相关病毒(adeno-associated virus,AAV)衣壳,该衣壳已广泛用于中枢神经系统疾病的临床试验,同时也用于一种获得监管部门批准的治疗罕见的嵴髓性肌肉萎缩症神经肌肉疾病的产品中。Etx101通过侧脑室内输注(ICV)传递,神经外科医生认为这是一种安全和标准的程序,用于传递抗生素和酶替代疗法等药物。对中枢神经系统的局部 ICV 注射 aav- 介导的基因治疗增强了药物对癫痫发作和神经认知的关键脑结构的传递,从而增加了一次性注射的疗效潜力。

 etx101临床前数据包展示了在非人灵长类动物(NHPs)相关中枢神经系统结构中广泛的分布,以及 Dravet 小鼠模型的长期存活和癫痫发作的减少。

Benchling

了不起和有意思的生信软件。

传统的研发软件是对科学潜力的消耗。它减缓了研发进程,将数据分散到各个领域,并消灭了机构知识。Benchling 是业界领先的生命科学研发云。加速、测量和预测研发——从发现到生物加工——都集中在一个地方。

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