耶鲁大学的 Morgan Levine 探索表观遗传老化时钟的潜在特征。

摩根莱文,耶鲁大学
Aubrey 的贡献在 47:44,Keith Comito(以及其他人),5:05 是甲基化的定义。

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来自耶鲁大学的 Morgan Levine 将与我们一起讨论她最近的文章,“表观遗传老化时钟的潜在特征”,她与人合着。

该演示文稿将比较和对比表观遗传时钟,并描述如何解构这些时钟,以提高我们对与表观遗传衰老相关的原因和后果的理解。

文章摘要

基于 DNA 甲基化的表观遗传时钟的发展已被广泛用于量化各种组织/细胞的生物衰老。 存在许多表观遗传时钟,但它们之间的相关性并不强,这表明它们可能捕获不同的生物过程。 从不同人体组织/细胞收集的多组学数据用于识别 11 个表观遗传时钟的共同特征。 多组学分析显示,五个时钟(Horvath1、Horvath2、Levine Hannum 和 Lin)在纯化的 CD14+ 单核细胞和背外侧皮层之间共享转录关联,尽管 CpG 明显缺乏。 由共享转录关联丰富的途径表明表观遗传衰老与新陈代谢、免疫系统和自噬之间存在联系。 体外结果表明,Levine 和 Lin 时钟根据两个衰老标志加速:线粒体功能障碍和细胞衰老。 我们使用来自多个组织的数据开发了一个元时钟来解构表观遗传时钟信号。 这个时钟显示出更好的死亡率预测,并且与体外标志更密切相关。

摩根的简历:

耶鲁大学医学院病理学系助理教授、耶鲁大学计算生物学和生物信息学联合项目和耶鲁大学衰老研究中心的成员 Morgan Levine 是阶梯级别的。 她的工作基于跨学科方法,将统计遗传学和计算生物学的理论和方法与数学人口统计学相结合,利用组学的高维数据开发人类和动物模型衰老的生物标志物。 作为 PI、合作研究员或首席研究员,她在多个 NIH、基金会和大学资助的项目中拥有丰富的经验。 这些项目使用系统级机器学习来跟踪表观遗传变化、转录组学和蛋白质组学随衰老的变化,并将这些数据纳入阿尔茨海默氏症和癌症等主要慢性病的风险分层措施中。 她的工作涉及开发系统级的老化结果测量,以促进对老年保护干预的评估。 她在基础研究和观察研究中使用了许多生物老化测量方法。

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